2017国际植物表型网络(IPPN)年度报告

发布时间:2018-01-04


国际植物表型网络(IPPN)近期发布的2017年度报告,谷丰光电现对其进行翻译整理与广大植物表型学者分享。

摘要

IPPN旨在促进全球范围内重要植物表型鉴定中心之间的讨论交流,并与来自学术界和工业界的表型科学家,用户和技术开发者进行讨论。主要活动包括:

 

Ⅰ. 2017 IPPN主要活动

1.1国际植物表型研讨会(IPPS)和表型会议


1.1.1基于第四届IPPS的特刊

参与组织第四届IPPS的IPPN同事与Matthew Reynolds共同担任编,组织一期在《crop science》上的特刊。

下一步: Matthew Reynolds正在与撰写杂志评论。


1.1.2“IPPN象征树”

IPPN办公室正协调在国际植物形态学研讨会(堪培拉,Julich,Chennai,El Batan)的不同地点种植栽培树木,并建立一个network。


1.1.3会议精简和协调

为了精简会议,尽量减少重叠的国际表型会议,IPPN办公室联系了其他会议组织者(包括Lemnatec, Phenospex, PSI, ASPB, CPPN, LatPPN等),将重点放在植物表型技术本身上,并与他们讨论如何协调会议。许多组织都表示有兴趣与IPPN合作以减少潜在的会议冲突。Lemnatec已经停止组织Phenodays,他们有兴趣与IPPN联手举行未来的国际表型会议。


1.1.4阿德莱德第五届表型组国际会议

IPPN在阿德莱德大学的同事和APPF正在就准备于2018年10月在阿德莱德举办的第五届IPPS与IPPN工作组合作


1.2会员

1.2.1新成员

在大会正式批准之前,IPPN欢迎新成员的加入:

下一步:IPPN成员和IPPN办公室应进行互动,以进一步增加成员数量 - 特别是在目前没有IPPN成员的。根据上次IPPN委员会的建议,IPPN提出如何支持发展中的成员资格的建议。


1.2.2行业互动和会员选择

大会授权IPPN执行委员会开始与工业界讨论IPPN内潜在的相互作用。CIMMY的IPPN研讨会期间,在Jülich主导的表型研讨会上,组织了两次面对面的会议。此外,与IPPN理事会确定的行业成员进行了一些视频会议讨论。目前,多个工业界成员提供了加入IPPN的意向书。在讨论的基础上,IPPN起草了一个新版本的章程,修改成包括工业界成员。


1.3支持5个工作小组

IPPN办公室支持他们组织部分会议(例如公告等),跟踪活动并要求工作组的业务计划。目前,每个工作组根据其提供的商业计划获得每年高达5000欧元的支持,该计划经IPPN董事会批准。

为早期职业科学家提供旅行补助;

IPPN委员会决定支持早期的职业科学家提供差旅补助金,参加CIMMYT的第四届IPPS,授予:

此外,在工作组活动的框架内,还支持进一步的早期职业科学家参加第4届IPPS的根卫星会议:

后,在密苏里州的IPG根生物学会议的与会者得到了根工作组框架的支持:

下一步:继续开展这项活动,增加年轻研究人员参与IPPN研讨会的工作。


1.4通讯

1.4.1网站更新

IPPN网站进一步扩展:


1.4.2社交媒体和互联网

为了更广泛的传播IPPN的信息并分享同事的活动,我们建立了一个Twitter帐户。

为了分享在IPPN活动上的谈话,我们建立了自己的YouTube频道。您可以在频道上找到座谈会和研讨会的谈话。

Twitter: https://twitter.com/IPPN

YouTube: https://www.youtube.com/channel/UC7uUa8CGxCuGCgT4YVUffwQ

 

Ⅱ. 2018年IPPN办公室活动计划

在2018年,如果我们把IPPN扩大到工业界,我们将迎来大约15名新成员。这些新成员中的大多数来自于工业界,更多来自学术界,主要来自我们已经讨论过的单位。

IPPN办公室提出:

 

Ⅲ. 工作组

3.1低成本表型技术研究小组

目标:本工作组侧重于低成本和便捷的表型技术,以加强传播现代表型的概念和方法。应该解决更广泛的植物科学和繁殖群体直接获取和使用现代表型装置和概念的需求,以满足表型技术多样化需求。

活动:工作组于5月15日至17日举行了次研讨会,该研讨会吸引了来自世界各地的40多名与会者。研讨会侧重于低成本的表型分析方法,并且还有表型仪器实际操作的示范。工业界也有很好的代表,这可能为IPPN拓展未来的会员基础铺平道路。会议报告已经发布在网站上。

2018年计划:


3.2表型影像工作组

目标:工作小组的目的是通过为开发者和用户提供一个讨论新出现的挑战、方法、技术和应用的论坛,来推进基于图像的植物表型的方法研究。通过设立这个工作组,国际社会将有一个在项目之外进行互动的平台。

活动:

?)成像工作组正在运行一系列有关主题的在线网络研讨会。这些网络研讨会旨在增加网络和信息共享。会员可以观看国际的现场对话,提问,并通过音频和文本聊天工具讨论问题。

在线研讨会加入地址: http://join.me/plant-phenotyping

网络研讨会录音网站 (https://www.plant-phenotyping.org/Imaging-Workgroup-Webinars):

影像工作组计划在未来举办更多的网络研讨会,以涵盖相关主题,旨在发挥指导作用,增加网络和信息共享。

?)2017年10月,成像工作组在ICCV上举行CVPPP研讨会。ICCV是全球范围内有声望的国际计算机视觉会议。今年在意大利的威尼斯举办。影像工作组获得了从Lemantec和Phenospex的赞助,以支持受邀演讲者的旅费。

?)成像工作小组也于7月份在瓦赫宁根开设了暑期学校。因为暑期学校的重点是对植物的表型做一个概述,观众是新来的科学家和学生。

?)成像工作组活跃于网络。要了解更多有关他们的活动,请访问以下链接,这些链接可在他们的主页上访问(https://www.plant-phenotyping.org/ippn_wg_imaging):

网络研讨会:https://www.plant-phenotyping.org/Imaging-Workgroup-Webinars

博客:https://plant-phenotyping.tumblr.com/Twitter

推特:https://twitter.com/IPPNImagingWG

2018年计划

研讨会

网络研讨会


3.3根系表型工作组

目的:工作组旨在成为一个论坛,以确定根表型的科学和技术界限,促进根表型,加快应用于全球农业和环境挑战。

活动:为了支持早期职业科学家,根表型工作组再次向在美国密苏里州参加IPG根生物学会议的三名受助者提供旅行补助(https://www.plant-phenotyping.org/travel_grant_Root_Biology_Meeting)。三名接收人是:

三名接受人在会议上出示了一张密苏里州的海报。

该组织欢迎诺布尔研究所的Larry York作为新的委员会成员。

2018年计划

面对面会议:

田间根表型培训研讨会

2019年计划

根表型研讨会

白皮书


3.4种子表型工作组(SPWG)

目的:SPWG应以加强种子表型创新为目标,切实加快具体目标的进展。具体目标包括:

1)为IPPN会议提供建设性的意见,并阐述利用新技术发展种子库和创新农业的好处;

2)在表型数据方面促进种子库的数据共享和交换,互用性,数据使用,数据分析和佳实践;

3)通过合作、倡导、研究、开发和实施多学科的资源和机会,建立一个植物表型支柱模型。

活动:于2017年9月在德国举办的“圆桌讨论:种子与种质表型”,在种子库和表型技术社区中建立起动力和兴趣,并与DivSeek GG:基因库表型进行合作。

2018年计划

通过各成员和部门的发展,建立种子库的表型能力。

第二届亚太植物表型会议(2018年3月,南京举办)

2019年计划

继续发展战略联盟和伙伴关系,通过联合研究和出版物来促进种子表型分类,并实现技术进步的更大影响力。


3.5国际受控环境植物表型组(ICEPPG)

目的:ICEPPG专注于评估在明确的实验条件下模拟各种现在和未来气候情景的植物性能特征,并旨在将研究人员聚集在一起,模拟不同受控环境中运行植物表型平台,研究人员包括植物遗传学家,(生态)生理学家,发育生物学家,农艺学家,气候研究员,土壤学家,生物信息学家和生物学家,以及与植物发育、生理过程和气候情景建模相关的其他相关领域的科学家,传感技术开发者使用设施或贡献的概念,技术和方法开发。

活动:计划于2018年开展新活动。

2018年及以后的计划:


3.6 IPPN数据管理(IDaM)

目的:进行中

活动:进行中

 

3.7 深度植物表型分析

目的:进行中

活动:新成立于2017年


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