一、USGS 的地下水软件
从上世纪70年代初开始，美国地质调查局（USGS）就开始从事地下水模型的开发和应用。在过去的35年间，USGS已经开发出了一系列计算机模型来模拟饱和的和非饱和的地下水流、溶质运移和化学反应。USGS网站上公布了地下水相关软件55套，其中淘汰一套。
以下是USGS网站近期发布和更新的软件：
CFP(Win)
MODFLOW2005的导水流进程。2008/04/14， Version 1.0
GSFLOW (Linux/Win)
基于美国地质调查局的降雨汇流模型和地下水流模型（MODFLOW-2005)的地下水和地表水汇流模型。2008/03/05， Version1.0.00
HYDROTHERM (Linux/Win)
模拟多方面地下水流和摄氏0至1200度的热运移的三维限差模型。2008/03/01， Version 3.1.0
SEAWAT
三维变密度地下水流动模拟。2008/03/28，Version 4.0
Utility PIEs (Win)
美国地质调查局地下水模型地理信息简析。2008/04/02，Version 1.7.11.0
二、国际上常用的地下水软件
在地下水文学方面，通过近二十年的研究与发展，国际上已经形成了一批非常有影响的地下水模拟软件，它们在国际地下水模拟研究领域依旧非常活跃。
1、GMS地下水模拟系统
地下水模拟系统(Groundwater Modeling System)，简称GMS，是美国Brighamrsity在综合已有地下水模型MODFLOW、MODPATH、MT3D、FEMWATER、RT3D、SEEP2D、SEAM3D、UTCHEM、PEST、UCODE、NUFT等地下水模型而开发的可视化三维地下水模拟软件包。
2、MT3DMS
1990年由美国环境保护署资助开发MT3D，1998年，在美国部下属陆军工程师兵团研究开发中心项目的资助下开发出来了基于MT3D的第二代MT3DMS。目前，MT3DMS是应用为广泛的三维地下水溶质运移模拟软件。
3、MODFLOW
MODFLOW (The modular finite–difference groundwater flow model)，由美国地质调查局开发。从1984年首次发布MODFLOW后，已成为世界上使用广泛的三维地下水水流模型。
4、PHREEQC
PHREEQE是1980年美国地质调查局开发。1995年编译成的C语言版本是进行低温水文地球化学计算的计算机程序。
5、FEFLOW三维地下水流模拟软件
由德国wasy公司开发，FEFLOW是为满足专门从事复杂地下水模拟工程的对技术的要求而设计的。是迄今为止功能为齐全的地下水水量及水质计算机模拟软件系统。
6、Visual Groundwater三维可视化地下水软件
是由加拿大Waterloo水文地质公司开发的地下数据和地下水模拟结果三维可视化与动画软件。
7、Visual Modflow 三维可视化地下水水流模型
是由加拿大waterloo水文地质公司在Modflow软件基础上应用现代可视化技术开发研制的1994年8月首次在国际上公开发行。
三、其他地下水软件
目前，世界上地下水及其相关模拟软件多达数百个，但由于地下水系统的复杂性，至今，还没有任何一种地下水软件能解决一切地下水问题。以下资料仅作为了解。
1、HST3D 三维热及溶液运移模型
是一个三维热及溶液运移模型(3DHeat&Solute Transport Model)。
2、HydroGeo Analyst
是由Waterloo开发的一款专门用来对地下水和钻孔数据进行管理的软件。
3、ArcWFD水资源管理系统
是德国wasy公司在ArcGIS基础上开发而成的信息系统，主要用于在欧洲水框架指令下流域的管理和规划、可持续发展控制，以及地表水的生态环境控制。
4、GW-Base地下水管理系统软件
由德国RIBEKA公司开发。GW-Base地下水管理系统软件是地下水从业人员研究分析及预测水位、水质变化趋势的工具。
5、WISKI
德国Kisters公司开发的水文水资源基础信息处理分析系统（WISKI），是目前国际上较的、成熟的和完整的水文水资源及水环境的基础信息处理分析系统。
6、FRACTRAN
是一个二维有限元模型，用于模拟裂隙多孔介质中的稳定水流和非稳定污染物运移。
7、RBCA Tier 2 Analyzer
利用一个新颖的水流解析解来快速和容易地模拟地下水流系统，对于许多复杂的涉及地下水污染生物降解的反应和过程，它提供了严谨的解决方法。
8、Visual Help
是的水文地质模拟环境，用于填埋场的设计、预测淋滤液堆积和评估淋滤液向地下水的渗漏。
9、Unsat Suite
是一个完全整合的软件包，它包括了模拟一维非饱和带地下水流和污染运移的广为应用的模型（如SESOIL VS2DT VLEACH PESTAN 和 HELP 模型）。
10、WQ Stat Plus
是水质按统计学方法分析地表水和地下水数据的工具。
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