毛细管色谱柱类型的选择:namespace prefix = o ns = "urn:schemas-microsoft-com:office:office" />
当面对一个未知物时，先试用现有GC柱，如果该柱分离不理想，根据你对样品的了解，基本原则是分析物与固定相有相似化学性质时才会相互作用。这说明对样品越了解，越容易找到合适的固定相。
非极性分子：通常仅由C和H组成并且无偶极距，直联（正烷）是常见的非极性化合物的例子
极性分子：主要由C和H组成同时也有其他原子，如：N、O、P、S或卤素。样品包括有醇类、胺类、硫醇类、酮类、有机卤化物等。
可极化物质：主要由C和H组成同事包含不饱和键。通常有炔和芳香族化合物。
如果你的样品是具有相似的化学性质的非极性组分的混合物，比如大多数石油馏分中的烃，你可以试用SE-30毛细管色谱柱，它按沸点顺序分离。如果你怀疑有芳香族化合物，试着用有苯基的SE-54或OV-35柱。
极性或可极化组分样品能够在中性和或可极化固定相色谱柱上进行分析，如有苯基或类似基团固定相，比如OV-17或OV-225柱。如果需要更高极性，可以选用聚乙二醇（PEG）固定相，即通常所说的WAX固定相。
