RT-PCR是指将逆转录(Reverse Tranion;RT)反应和PCR (Polymerase Chain Reaction)反应组合在一起的方法。
1、RT-PCR的原理
RT-PCR将以RNA为模板的cDNA合成同PCR结合在一起,提供了一种分析基因表达的快速灵敏的方法。RT-PCR用于对表达信息进行检测或定量。另外,这项技术还可以用来检测基因表达差异或不必构建cDNA文库克隆cDNA。RT-PCR比其他包括Northern印迹、RNase保护分析、原位杂交及S1核酸酶分析在内的RNA分析技术,更灵敏,更易于操作。
RT-PCR的模板可以为RNA或poly(A)+选择性RNA。逆转录反应可以使用逆转录酶,以随机引物、oligo(dT)或基因特异性的引物(GSP)起始。RT-PCR可以一步法或两步法的形式进行。在两步法RT-PCR中,每一步都在*条件下进行。cDNA的合成首先在逆转录缓冲液中进行,然后取出1/10的反应产物进行PCR。在一步法RT-PCR中,逆转录和PCR在同时为逆转录和PCR优化的条件下,在一只管中顺次进行。
2.2 RT-PCR的步骤
⑴在冰浴离心管里面加入模板RNA 4uL,引物2uL,去离子水5uL,混匀,离心3-5秒;
⑵70度水浴5分钟,冰浴30秒(此处是为了使引物和模板正确配对);
⑶加入5×反应液4uL,RNase抑制剂1uL,dNTP 2uL(这些应该先配好,然后分再装到每一管),混匀;
⑷37度水浴5分钟,加入1uL AMV-RT反转录酶,混匀;
⑸37度水浴1小时(此步是反转录过程);
⑹70度10分钟结束反应(此处是灭活酶活性,避免对后续实验产生干扰),产物置冰上进行下一步PCR实验,余下的-70度保存。