核酸提取PCR荧光定量PCR常见问题解析

发布时间:2015-01-28

部分 核酸DNA和RNA提取常见问题分析 

1.  RNAfixer的工作原理?

       浸入组织,抑制RNase的活性。运输方便,是非液氮类的一种样品储存液。 

2.  对于内源RNase丰富的组织和样品,如何消除RNase?

       可以在提取时候多加裂解液,比如4:1等。 

3.  TRIpure and RNApure区别?

       胍盐类的裂解液一样,RNApure附加有离心柱,和漂洗液,是Kit。 

       TRIpure只是裂解液。 

4.  凝血的gDNA和RNA的提取与新鲜血的提取不同?

       需加一个分离柱(separate column)分开凝血。 

5.  microRNA提取和定量?

       过2次离心柱,得到200bp一下的小RNA。可以测定OD定量。 

6.  血清,血浆,血液RNA提取的区别?以及Viral RNA提取的方法?

       液体类样品RNA提取用TRIpure LS。一般血清、血浆是无细胞样品,含游离的RNA,量比较少,建议加Carrier RNA在提取时候。 

病毒RNA提取好加Carrier RNA在提取时候,BioTeke有专门的病毒RNA提取试剂盒。

7.  通用植物RNA提取常见问题:蛋白质污染?

       DNA污染-DNaseI消化(Kit does not provide it please get it from other companies.) 

8.  真菌RNA提取

       可用RNApure 或者通用植物RNA提取Kit。 

9.  DNA cleanup from gel and PCR 区别?

       胶回收含有一个溶胶液。多功能胶回收可以用于胶回收和PCR产物回收。 

10.  土壤DNA提取优点?

       无需要机械破碎样品和过柱的纯化方式,减少DNA的锻炼和得率,达到实验目的。 

 

第二部分PCR/RT-PCR常见问题解答 

1.  二次PCR无目标产物,电泳孔道亮?

       Template稀释和重新设计引物

2.  microRNA的反转录问题?

       microRNA反转录和普通的mRNA的反转录不一样。现在常见的microRNA反转录引物有2种,一个是step-loop结构;另外一种是3末端加polyA后,再用oligo(dT)逆转录。BioTeke有microRNA提取和2-step real-time PCR Kit。

3.  cDNA的合成(RT)电泳,以及cDNA第二链的合成问题?

       2-5uLcDNA产物电泳有模糊条带出现。第二链合成也有专门的试剂盒。BioTeke现在没有此类产品。

4.  Power Mix扩增不因素?

       产品或者引物或者目的基因的不表达。

5.  RT-PCR没有扩增产物?

       可能是引物,模版,产品等。

 

第三部分Real-time qPCR 常见问题分析 

1.  做标准曲线时候,可否用2个不同体系浓度的稀释分别对于内参和目的基因?

       建议好用同样稀释倍数做曲线,因为模板浓度会影响扩增效率。

2.  熔解曲线中,Tm不出现在80度左右?

       扩增片段100bp左右的,一般应该出现在80度左右。如果低于此温度出现,可能是模板降解。

3.  扩增曲线没有Ct值,仅仅一条斜线?什么原因?

       模板浓度过低或者模板降解。

4.  如果内参和目标基因表达量差别比较大,也就是目的基因的表达量少,Ctcon=15,Cttarget=38,可否应用?

       可以用于数据分析。因为表达量低,从而用过高模板进行扩增,从而同内标的模板不同,反而会增大数据统计的误差。

5.  引物浓度可否是50nM,是否太低?

       如果扩增曲线和熔解曲线比较好,这个浓度当然可以。如果更低,扩增结果好的情况下,同样可以运用。

 

上海旦鼎国际贸易有限公司

上海市浦东新区金桥路939号宏南投资大厦1110室

联系电话:  

传真:

邮箱:dandingmaoyi@163.com

网站:www.dookings.com

上一篇:如何保证实验安全
下一篇:小型制冰机常见故障整理