部分 核酸DNA和RNA提取常见问题分析
1. RNAfixer的工作原理?
浸入组织,抑制RNase的活性。运输方便,是非液氮类的一种样品储存液。
2. 对于内源RNase丰富的组织和样品,如何消除RNase?
可以在提取时候多加裂解液,比如4:1等。
3. TRIpure and RNApure区别?
胍盐类的裂解液一样,RNApure附加有离心柱,和漂洗液,是Kit。
TRIpure只是裂解液。
4. 凝血的gDNA和RNA的提取与新鲜血的提取不同?
需加一个分离柱(separate column)分开凝血。
5. microRNA提取和定量?
过2次离心柱,得到200bp一下的小RNA。可以测定OD定量。
6. 血清,血浆,血液RNA提取的区别?以及Viral RNA提取的方法?
液体类样品RNA提取用TRIpure LS。一般血清、血浆是无细胞样品,含游离的RNA,量比较少,建议加Carrier RNA在提取时候。
病毒RNA提取好加Carrier RNA在提取时候,BioTeke有专门的病毒RNA提取试剂盒。
7. 通用植物RNA提取常见问题:蛋白质污染?
DNA污染-DNaseI消化(Kit does not provide it please get it from other companies.)
8. 真菌RNA提取
可用RNApure 或者通用植物RNA提取Kit。
9. DNA cleanup from gel and PCR 区别?
胶回收含有一个溶胶液。多功能胶回收可以用于胶回收和PCR产物回收。
10. 土壤DNA提取优点?
无需要机械破碎样品和过柱的纯化方式,减少DNA的锻炼和得率,达到实验目的。
第二部分PCR/RT-PCR常见问题解答
1. 二次PCR无目标产物,电泳孔道亮?
Template稀释和重新设计引物
2. microRNA的反转录问题?
microRNA反转录和普通的mRNA的反转录不一样。现在常见的microRNA反转录引物有2种,一个是step-loop结构;另外一种是3末端加polyA后,再用oligo(dT)逆转录。BioTeke有microRNA提取和2-step real-time PCR Kit。
3. cDNA的合成(RT)电泳,以及cDNA第二链的合成问题?
2-5uLcDNA产物电泳有模糊条带出现。第二链合成也有专门的试剂盒。BioTeke现在没有此类产品。
4. Power Mix扩增不因素?
产品或者引物或者目的基因的不表达。
5. RT-PCR没有扩增产物?
可能是引物,模版,产品等。
第三部分Real-time qPCR 常见问题分析
1. 做标准曲线时候,可否用2个不同体系浓度的稀释分别对于内参和目的基因?
建议好用同样稀释倍数做曲线,因为模板浓度会影响扩增效率。
2. 熔解曲线中,Tm不出现在80度左右?
扩增片段100bp左右的,一般应该出现在80度左右。如果低于此温度出现,可能是模板降解。
3. 扩增曲线没有Ct值,仅仅一条斜线?什么原因?
模板浓度过低或者模板降解。
4. 如果内参和目标基因表达量差别比较大,也就是目的基因的表达量少,Ctcon=15,Cttarget=38,可否应用?
可以用于数据分析。因为表达量低,从而用过高模板进行扩增,从而同内标的模板不同,反而会增大数据统计的误差。
5. 引物浓度可否是50nM,是否太低?
如果扩增曲线和熔解曲线比较好,这个浓度当然可以。如果更低,扩增结果好的情况下,同样可以运用。
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