研究分子生物学的在以前已经装配了普通凝胶成像分析系统，这两年有一些有远见教授或者研究到化学发光成像和多色荧光成像方向的实验室已经装配了，化学发光成像分析系统，多色荧光成像分析系统，这有部分已经有一定的数量了。极少数实验室也装配了多功能活体成像分析系统，这在是属于极少数的。第二类是研究和生物相关的交叉和边缘学科实验室，才刚刚装配普通凝胶成像分析系统，并且这部分老师对分子影像成像分析系统还没有完整的了解和系统的操作，他们选择子影像成像分析系统更没主意。从现在大的发展方向来看，研究分子生物学的已经在普通凝胶成像分析系统的基础之上开始向化学发光成像分析系统，多色荧光成像分析系统走的趋势，但是在这中间有一个很大的问题就是绝大多数的老师很想向化学发光成像分析系统，多色荧光成像分析系统做，并且他们有很多已经做到这个方向，但是这些老师没有接触过过化学发光成像分析系统，多色荧光成像分析系统，对他们的具体的功能和操作都没有足够的知识，特别是在荧光染料的选择上面和实际的动物及各种样本的处理方面有一定得难度。
基于上面的三点所以分子影像成像分析系统的选择应该遵循以下这样的几个原则：
1.分子影像成像分析系统的厂商的产品线要拥有普通凝胶成像分析系统。化学发光成像分析系统，多色荧光成像分析系统，多功能活体成像分析系统这些比较长的产品线，这样可以给老师足够的选择空间。并且可以从普通凝胶成像分析系统可以升级到化学发光成像分析系统的空间，从化学发光成像分析系统升级到多色荧光成像分析系统的空间，从多色荧光成像分析系统升级到多功能活体成像分析系统的空间。
2.选择的应该拥有生产分子影像成像分析系统的主要零部件的能力，特别是CCD的生产，滤光镜片和多功能软件这些主要部分，这样可以为客户以后的维修零部件的价格较低和质量的保证，同时这样的厂家整套仪器的价位也可以有所降低。
3.分子影像成像分析系统的好同时拥有分子影像成像系统和数字成像系统生产能力，或者有分子影像成像系统和数字成像系统相结合的产品，因为现在的数字成像系统已经在各个领域应用非常的广泛，以后分子影像成像系统和数字成像系统相结合一定是一个新的趋势。
4.分子影像成像分析系统的选择，特别是在选择化学发光成像分析系统，多色荧光成像分析系统，多功能活体成像分析系统的时候，特别要注意是否有强大的技术支持才可以，因为现在化学发光成像分析系统，多色荧光成像分析系统，多功能活体成像分析系统还没有普遍，这些方面的知识和技术还不普遍，特别是，多功能活体成像分析系统更是如此。
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