货号:59104 亚硫酸氢盐转化试剂盒 (48)

发布时间:2018-06-11

英文名称:EpiTect Bisulfite Kit (48)
中文名称:亚硫酸氢盐转化试剂盒 (48)
品       牌:QIAGEN
货       号:59104

亚硫酸氢盐的完全转化和DNA回收,用于甲基化分析

EpiTect Bisulfite Kit可在6小时内将DNA 序列中非甲基化的胞嘧啶完全转化为尿嘧啶。EpiTect 96 Bisulfite操作时间少于7小时。高灵敏度的方法采用全新的保护机制防止DNA降解,确保即使是1 ng的DNA也可获得灵敏的结果,转化率可高达99%。得益于的DNA保护技术,EpiTect Bisulfite转化后DNA高度适用于EpiTect Whole Bisulfitome Kits转化后全基因组扩增。因此可在转化后DNA量较少的情况下确保可靠的扩增。EpiTect Bisulfite Kits包括离心柱或96孔板形式的扩增和脱磺酸基过程,确保快速可靠的实验结果用于下游应用。两个试剂盒都可用于离心机或真空装置,另外,EpiTect Bisulfite Kit可在QIAcube全自动核酸纯化仪上全自动运行。

特点

参数

应用Multiplex PCR, real-time PCR, sequencing
转化效率99.4–99.8%
洗脱体积Varies
规格Spin column and 96-well plate
处理Manual (spin and vacuum)
样本量1–2 µg
样本类型Blood, (FFPE) tissue, DNA samples
每次运行或制备时间<6 hours (1-48 samples), ~ 7 hours (48-96 samples)
产量Depends on input amount of purified genomic DNA used for conversion


性能

快速得到实验结果

完整的EpiTect离心和真空过程只需6小时,包括从DNA到待分析的亚硫酸氢盐转化后的高纯DNA。EpiTect 96 Bisulfite操作时间少于7小时。传统的亚硫酸氢盐转化过程需要18个小时,且需要大量的操作(参见快速简单的亚硫酸氢盐转化Time saving procedure)。EpiTect Bisulfite Kit为进行亚硫酸氢盐转化和DNA回收提供所需的全部试剂。

快速简单的亚硫酸氢盐转化
 EpiTect流程传统流程
反应构建10分钟;预制溶液40分钟;需反应构建
亚硫酸氢盐转化5小时16小时
纯化30–45分钟; EpiTect离心柱或孔板120分钟;纯化、脱璜、沉淀和洗涤

完全的DNA转化

每个EpiTect Bisulfite Kit可以相同的效率转化低至1 ng到2 µg DNA。全新的实验步骤和优化的缓冲液可回收得到高产量的转化DNA。当通过real-time PCR扩增经转化的DNA时,低CT值的实验结果显示了高效的胞嘧啶转化(参见Complete cytosine conversion)。对转化的DNA的分析显示,EpiTect Bisulfite Kit可转化过99%的非甲基化的胞嘧啶(参见Highly efficient cytosine conversion)。高转化率确保了高重复性和可靠的下游分析结果。

原理

特殊样本的亚硫酸氢盐转化

从珍稀样本和少量样本(如:福尔马林固定、FFPE石蜡包埋或显微切割组织)中确定甲基化模式,由于DNA的量很少,实验尤其困难。但是这些样本类型是鉴定有价值的疾病,预测生物标记物的专门研究对象。 EpiTect Bisulfite Kit 为这些类型的样本提供优化的操作流程,从而解决了难题(参见Methylation detection from FFPE tissue samples)。该试剂盒含有实验所需的全部缓冲液和试剂,只需少量的手动操作。

对于从FFPE样本、细胞、血液及组织中直接进行亚硫酸氢盐转化而无需预先分离DNA,我们使用EpiTect Plus FFPE Bisulfite Kit和EpiTect Plus LyseAll Bisulfite Kit。

防止DNA降解

DNA保护缓冲液采用的配方,防止DNA过度降解(在高温、低pH值条件下使用亚硫酸氢盐处理DNA时经常出现严重的DNA降解),并实现有效的DNA变性,从而产生完全转化为胞嘧啶时所需的单链DNA(参见Unique DNA Protect Buffer and pH indicator system)。防止DNA降解的发生可以保证后续大PCR片段的扩增和分析(参见Fast and easy bisulfite conversion)。DNA保护缓冲液含有PH指示剂染料,从而可保证用于胞嘧啶转化的正确的pH条件。有效的完整DNA回收可保证转化后的DNA至少保存12个月而不影响DNA的质量(参见Long-term DNA storage)。

操作流程

EpiTect Bisulfite操作流程基于QIAGEN简单直接的结合、洗涤和洗脱体系,仅需几个简单的步骤(参见Conversion procedure)。DNA经过热变性和亚硫酸氢盐转化后,被上样到EpiTect离心柱或96孔板上,使用优化的缓冲液和标准化的离心步骤或真空装置,洗去所有的亚硫酸氢钠并洗脱DNA。洗脱的DNA可用于各种下游应用,如:甲基特异性PCR、real-time PCR分析、亚硫酸氢盐转化后测序(bisulfite sequencing)、结合亚硫酸氢盐的限制性内切酶法分析(COBRA)和焦磷酸测序(Pyrosequencing)。

表观遗传学信息对于生物医学研究(尤其是肿瘤学)、干细胞研究以及发育生物学等领域都非常重要。但是分析DNA甲基化的变化目前仍具有挑战性,因为缺乏标准化的方法可从有限的样本中得到可重现性的数据。QIAGEN推出新的表观遗传学解决方案,使样本分析前处理到分析整个过程实现标准化,即从DNA样本收集、稳定和纯化,到亚硫酸氢盐转化和real-time或终点式PCR甲基化分析或测序(参见Standardized workflows in epigenetics)。

应用

经EpiTect Bisulfite Kit转化和纯化的DNA适用于多种下游应用,如:


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