Western Blot如何选择内参

发布时间:2022-05-23

如何选择内参?

要检测一个基因是否有表达,或者比较表达水平的变化,*方式是Western Blot。因为Western Blot操作相对简单,既可以定性分析表达产物,还可以检测目的蛋白量的相对变化。在实验中,可能存在蛋白浓度测定不准确,或者蛋白质样品在上样时产生的操作误差。特别表达量不高时,蛋白定量或上样的误差很有可能影响结果的分析。

为了校正这个误差,Western Blot实验都需要进行内参检测。具体校正方法就是将每个样品目的含量与内参含量相除,得到每个样品目的蛋白的相对含量。再进行样品与样品之间的比较。

内参抗体种类很多,比如β-actin、β-tubunlin、GAPDH、Lamin B等,那么针对自己的实验,我们该如何选择呢?下面简单介绍下选择内参抗体应遵循的原则:

1.样本种属来源

首先要考虑的就是实验样本来源于什么物种。

(1)哺乳动物的组织或者细胞样本,通常选择β-actin、β-tubulin、GAPDH、Lamin B、Histone H3、Na,Katpase等。

(2)植物来源实验样本,则可以选择plant actin、Rubisco等。

(3)其他来源样本研究较少,所以就应该参照文献报导,选择合适的蛋白作为内参。

2.目的蛋白分子量

选择内参抗体时,应该考虑目的蛋白分子量的大小。通常应该保证目的蛋白与内参蛋白分子量相差5KD以上。比如目的蛋白分子量为45KD,此时不适宜选择β-actin作为内参,可以考虑选择GAPDH或者β-tubulin作为内参。

3.目的蛋白表达部位

就一般的蛋白检测来说,β-actin、β-Tubulin抗体等就可以了,而针对于核蛋白的定量,特别是样本蛋白就是核蛋白时,选择恰当的核蛋白内参则更能体现内部参照的价值。常用的核内参抗体有Lamin A、Lamin B、Histone H3,除此之外,其它常见的核蛋白内参还有PCNA、K70、K80等,在一些文献报道中,Erk2、TATA binding protein(TBP)以及c-Jun、c-Fos等都有使用。而对于膜蛋白检测,常用的内参抗体为Na,K ATPase。对于线粒体蛋白的检测,常用VDAC1和COX IV作为内参抗体。

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