相关知识
质粒(Plasmid) :独立于染色体外的,能复制且稳定遗传的遗传因子。是一种环状的双链DNA分子。存在于细菌、放线菌、真菌以及一些动植物细胞中,在细菌细胞中多。
蓝白斑筛选:
现在常用的质粒载体上都带有β-半乳糖激酶(LacZ)基因。载体上重组DNA的插入位点存在于特定遗传标记内部,外源DNA片段的插入会导致该遗传标记失活。本实验使用的载体含一个大肠杆菌DNA的小片段,其中含乳糖操纵子的启动子和β-半乳糖激酶基因,多克隆位点位于其编码区内。载体与编码β-半乳糖激酶C端的部分序列的宿主之间发生互补——α-互补,产生完整的β-半乳糖激酶活性的Lac+细菌。它们在生色底物存在下形成蓝色菌落。当外源DNA插入多克隆位点时,细菌不能产生β-半乳糖激酶,即使有生色底物存在,一般也会产生白色菌落。而无插入片段的重组细胞菌落将产生蓝色菌落。X-gal和IPTG是被用于鉴别蓝白菌落的底物,常涂布于固体培养基上。
质粒提取方法:
细菌的收获可通过离心来进行,而细菌的裂解可采用多种方法。这些方法包括用非离子型或离子型去垢剂、有机溶剂或碱进行处理及用加热处理等。选择哪一种方法取决于3个因素:质粒的大小、大肠杆菌菌株及裂解后用于纯化质粒DNA的技术。在实际操作中,可根据所使用的宿主菌及质粒的特性来选择合适的方法。本实验所介绍的碱裂解法提取质粒的方法是一种简便、快捷、效率高、消耗少的方法,适合于小量及大量、质粒的提取。其原理是用 EDTA和SDS破坏细胞壁和细胞膜,使质粒DNA分子,多聚核糖体及其他可溶物质从细胞中逐步释放,而染色体DNA分子与细胞碎片缠绕在一起,可经离心与质粒DNA分开。
质粒电泳:
质粒电泳一般采用琼脂糖凝胶电泳。电泳是分离、鉴定和纯化DNA片段的标准方法。该技术操作简便、快速,可以分辨用其他方法所无法分离的DNA片段。此外,直接用低浓度的荧光嵌入染料溴化乙锭进行染色,可确定DNA在凝胶中的位置。少至1-10 ng的DNA条带即可直接在紫外灯下检出。电泳后的DNA条带还可以从凝胶中回收,用于克隆操作。
影响DNA在琼脂糖凝胶中的迁移速率的因素有:
1)DNA分子的大小;2)DNA的构象;3)琼脂糖浓度;4)所用电压;5)碱基组成及电泳温度;6)电泳缓冲液的组成。
主要试剂
1. LB(+Amp)培养基
LB液体培养基内加入100mg/mL的氨苄青霉素。
2. 溶液I:50mM葡萄糖;25mM Tris –HCl,pH8.0;10mM EDTA(灭菌)。
溶液II:0.2mM NaOH,1%SDS。
溶液III:3 M乙酸钾,pH5.5(灭菌)。
3. 93.05g EDTA.Na2,8g NaOH ,充分溶解后调pH值至8.0。
4. 1M Tris-HCl(1000 mL)
121.1g Tris,49 mL浓HCl,充分溶解后调pH值至8.0。
5. TE溶液(1000 mL)
10mL 1M Tris-HCl(pH8.0),2mL 0.5M EDTA(pH8.0)(灭菌)。
9. RNA酶溶液
用双蒸水溶解成1mg/mL,在100度水浴15分钟,-20度储存。
10. TAE电泳缓冲液
50×: 242g Tris碱,57.1 mL冰乙酸,100mL 0.5mol/L EDTA (pH8.0)
11. 6×上样缓冲液 (100mL)
2.5mL溴酚蓝,40g蔗糖,37℃溶解。