如果牛奶中含有抗生素，不但对消费者有较大的危害，对于乳制品厂商也有不利的影响。虽然可以利用市面上的牛奶分析仪与乳制品检测仪检测出来，但是并不普及。其危害主要有以下几个方面[7, 8]：
(1) 有些人对抗生素过敏，食用含有抗生素的乳制品会造成不同程度的过敏反应，严重的可能危及生命。
(2) 长期食用含有抗生素的乳制品，相当于长期低剂量摄入抗生素，这样会使人体内的细菌产生抗药性，给今后患病时使用抗生素治疗带来不利的影响；另外还会破坏人体内正常菌群的平衡状态，使菌群失调，甚至造成二重感染，使重症患者病情难以控制。
(3) 牛奶中残留的抗生素会影响牛奶的品质，同时也影响牛奶的发酵，致使其深加工制品，如黄油、酸奶、奶酪等的产量和质量降低，给生产者造成经济损失。
(4) 一些性质稳定的抗生素被排泄到环境中会造成环境污染，破坏生态平衡。2010 年底到 2011 年初闹得沸沸扬扬的“级细菌”问题就是典型的抗生素滥用的后果。通过牛奶分析仪和乳制品检测仪可以检测，不过如果长期食用含有抗生素的乳制品，人体内很可能出现“级细菌” 这样人们在需要使用抗生素治疗时就会面临无药可用的状态，这样的后果是很严重的。
